Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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