Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CLDN19Q8N6F1 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms