Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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CHCHD4Q8N4Q1 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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CHCHD4Q8N4Q1 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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CHCHD4Q8N4Q1 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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