Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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