Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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RTN1Q16799 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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RTN1Q16799 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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RTN1Q16799 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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