Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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