Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms