Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms