Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SYPL1Q16563 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYPL1Q16563 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYPL1Q16563 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYPL1Q16563 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYPL1Q16563 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SYPL1Q16563 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SYPL1Q16563 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SYPL1Q16563 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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