Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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