Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
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