Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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