Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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