Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIP4Q15650 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms