Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SS18Q15532 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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SS18Q15532 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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SS18Q15532 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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SS18Q15532 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SS18Q15532 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SS18Q15532 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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