Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SHHQ15465 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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SHHQ15465 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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SHHQ15465 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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SHHQ15465 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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SHHQ15465 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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SHHQ15465 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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SHHQ15465 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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