Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RYR3Q15413 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RYR3Q15413 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RYR3Q15413 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RYR3Q15413 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RYR3Q15413 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RYR3Q15413 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RYR3Q15413 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RYR3Q15413 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RYR3Q15413 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RYR3Q15413 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RYR3Q15413 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
RYR3Q15413 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
RYR3Q15413 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
RYR3Q15413 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
RYR3Q15413 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 376 ms