Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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