Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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