Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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