Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HNF4GQ14541 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms