Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms