Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCOA4Q13772 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms