Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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