Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
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