Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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