Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDE3BQ13370 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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