Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF6Q13247 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms