Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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