Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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