Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms