Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms