Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms