Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
FAM3AP98173 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms