Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPREP23469 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPREP23469 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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