Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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PTPRBP23467 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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PTPRBP23467 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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PTPRBP23467 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
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PTPRBP23467 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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PTPRBP23467 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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PTPRBP23467 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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