Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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