Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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VEGFDO43915 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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