Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BRPF3Q9ULD4 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms