Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

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Length 1,053 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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SALL4Q9UJQ4 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SALL4Q9UJQ4 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL4Q9UJQ4 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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