Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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GDE1Q9NZC3 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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GDE1Q9NZC3 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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GDE1Q9NZC3 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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