Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms