Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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