Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CA13Q8N1Q1 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms