Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 SMIM12-201ENST00000417239 684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 PRAC1-201ENST00000290294 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 BSNDP4-201ENST00000436076 388 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS9-AS2-204ENST00000485174 573 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 CCNT1-206ENST00000640148 596 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms