Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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