Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms