Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms