Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NRF1Q16656 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NRF1Q16656 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NRF1Q16656 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NRF1Q16656 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NRF1Q16656 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NRF1Q16656 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.7 ms