Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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